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技术资料/正文
16S/18S/ITS扩增子测序
414 人阅读发布时间：2021-04-27 15:22
16S/18S/ITS扩增子测序
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序，目前主要是应用高通量测序技术对特定环境中特定遗传物质进行测序。大多数天然微生物都不能通过传统的分离培养方法进行分离和克隆，这对于天然微生物定性和定量，探索微生物多样性是严重的挑战。扩增子测序可以克服传统分离培养的弱点，对样品中的微生物进行定性和定量，目前在微生物多样性检测中广泛应用。16S和18S rDNA是细菌和真菌中16s或18s rDNA基因的高变区，而ITS（Internal Transcribed Spacer）则是细菌、真菌和古细菌中小亚基和大亚基rRNA基因之间的间隔区DNA。这些特定的遗传物质都包括进化保守性及进化可变区。由于PCR扩增容易，可以从少量DNA中扩增出来，而基因序列即使在近缘种间也有高度的变异，因而扩增子测序在分类学和分子系统学中得到了广泛的应用。
根据研究目的不同扩增子测序可细分为如下几个产品类型：
16S rDNA测序：16S rDNA是编码16S rRNA的基因，存在于所有细菌基因组。16S rDNA既能体现不同菌属之间的差异，又能利用测序技术较容易地得到其序列，目前被广泛用于病原菌的检测和鉴定。16S rRNA的可变区经常用于不同微生物群落的属或种系统进化分类。
18S rDNA测序：18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。在结构上分为保守区和高变区，保守区反映生物物种间的亲缘关系，高变区反映物种间的差异，18S rDNA在进化速率上相对于ITS更加保守。
ITS 测序：在真核生物中，18S rDNA和28S rDNA转录间隔序列称为ITS区。ITS由于是非转录区，承受的选择压力较小，变异强。ITS属于中度保守区域，利用它可研究种及种以下的分类阶元。
扩增子测序技术优势：
鉴定效率高：与克隆或培养等传统鉴定方法相比，微生物群16S/18S/ITS测序是一种更快、更准确的方法；
双区检测：针对一个或多个可变区域的灵活性，能够进行更长的序列读取，并能够对菌落进行更准确的分析；
较低的成本：与宏基因组测序相比，对测序深度的要求更低，性价比较高；
高灵敏度：可以鉴定出丰度极低的细菌。
扩增子测序实验流程：
扩增子测序分析流程：
扩增子测序服务优势：
经验丰富的技术人员，可以提供从实验设计、样品检测、数据分析等全套专业服务；
流程明确，减少不必要的样品和时间浪费，交付时间短；
不同来源样本采用不同提取方法和建库测序策略，满足多种环境研究需求；
百泰派克生物科技拥有蛋白组、代谢组等分析平台，可进行多组学整合分析，提升文章质量。
扩增子测序样品要求：
样品类型：Meta样品，如粪便、土壤等或Meta DNA样品均可进行检测。具体要求请咨询技术人员。
扩增子测序案例展示：
How to order?
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关于百泰派克
北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）成立于2015年，是国家级高新技术企业，业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块，从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关技术服务，为客户提供高性价比、高效率的技术服务。深耕蛋白鉴定、定量蛋白组（iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATCH）、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰（二硫键、糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化等）、靶向和非靶向代谢物检测。百泰派克生物科技检测平台包括：检测分析平台、蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白质从头测序平台、生物制药分析平台和流式细胞多因子检测平台。公司拥有独立的质谱实验室、色谱实验室、细胞培养室和免疫学实验室，以及高分辨率质谱仪和高效液相色谱。目前已与国内外多家药物研发企业，以及哈佛大学、北京大学在内的国内外高校建立了合作关系，协助客户发表了多篇中英文文章，包括Cell等多家高水平期刊。
公司自主检测平台发展至今，已覆盖蛋白质组学、代谢组学、生物制药、生信分析等多组学检测平台，积累了丰富的实践经验，凭借专业的技术和优质的服务水平，客户覆盖北京大学、清华大学、中科院等多所知名院校，也与国内外多家药物研发企业建立合作关系。公司始终致力于为各科研院校、企业和机构提供高效、准确、高性价比的蛋白质（组）研究技术包裹，助力客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破，为生命科学的发展做出贡献。
百泰派克技术平台
检测分析平台：多台高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱，NMR。蛋白质组分析平台：Label-free、iTRAQ、SILAC、SWATH、MRM；蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析、发现疾病标记物、发现药物靶标。
代谢组分析平台：靶向代谢组学、非靶向代谢组学、脂质组学分析；通量达1000种代谢分子、代谢通路分析、代谢靶标鉴定。流式细胞多因子检测平台：CBA、FlowCytomix；微量样品需求，分析多种细胞因子。
蛋白质从头测序平台：Obitrap Fusion Lumos质谱仪、PEAKS软件分析；100%序列测定，精准蛋白、抗体测序。
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流式细胞多因子检测平台：CBA、FlowCytomix；微量样品需求，分析多种细胞因子。