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多肽从头测序

613 人阅读发布时间:2021-04-27 12:03

多肽从头测序

多肽的序列分析常见的有两种方法:数据库搜索和de novo从头测序法。数据库搜索需要在已知/给定的数据库中进行搜库,从而对多肽序列进行识别。但是由于有些物种的数据库不足,很多新的或是活性肽无法在数据中匹配到。多肽从头测序可以解决这个难题。多肽从头测序是指在没有序列数据库的帮助下,利用串联质谱(MS/MS)获取肽的氨基酸序列的分析过程。优势在于,无论有没有理论数据库,抑或是新的,未知的多肽均可对其进行序列分析。

从头测序的基本原理是利用两个片段离子之间的质量差来计算肽链上氨基酸残基的质量。多肽从头测序技术的实现与质谱技术的发展紧密相关。近年来质谱的质量分辨率提高了好几个数量级,尤其是高精确质谱性能的显著提高为多肽序列分析提供了有力的基础。

技术资料图片1  多肽从头测序 高质量光谱理论碎片离子示意图
百泰派克生物科技使用 nanoLC-MS/MS纳升色谱结合串联质谱,提供基于质谱的多肽de novo从头测序服务,对多肽序列进行分析。百泰派克使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪实现对肽段样品的序列分析,Obitrap Fusion Lumos质谱仪是现在分辨率和灵敏度最高的质谱仪,保证了低丰度肽段碎裂片段鉴定的灵敏度;同时在肽段碎裂过程中采取HCDETD结合的模式,保证肽段碎裂片段的完整性。得到质谱原始数据之后,采用从头测序的方式对多肽序列进行推导。

样品制备的建议:
尽可能准备20 ug以上的样品,溶液和冻干粉均可。如果是溶液样品,buffer中不含有高盐、SDS等去垢剂。
**可咨询百泰派克生物科技的技术人员,有针对性的进行样品制备。

百泰派克生物科技可对来自液体及固体状态下的样品进行多肽序列分析。固体样品,使用冰袋运输即可;溶液样品,可进行真空抽干或冷冻抽干后,使用冰袋运输,也可通过干冰对样品进行运输。欢迎来电咨询。

How to order?
技术资料图片2

 

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关于百泰派克

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP)成立于2015年,是国家级高新技术企业,业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块,从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关技术服务,为客户提供高性价比、高效率的技术服务。深耕蛋白鉴定、定量蛋白组(iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATCH)、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰(二硫键、糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化等)、靶向和非靶向代谢物检测。

百泰派克生物科技检测平台包括:检测分析平台、蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白质从头测序平台、生物制药分析平台和流式细胞多因子检测平台。公司拥有独立的质谱实验室、色谱实验室、细胞培养室和免疫学实验室,以及高分辨率质谱仪和高效液相色谱。目前已与国内外多家药物研发企业,以及哈佛大学、北京大学在内的国内外高校建立了合作关系,协助客户发表了多篇中英文文章,包括Cell等多家高水平期刊。

公司自主检测平台发展至今,已覆盖蛋白质组学、代谢组学、生物制药、生信分析等多组学检测平台,积累了丰富的实践经验,凭借专业的技术和优质的服务水平,客户覆盖北京大学、清华大学、中科院等多所知名院校,也与国内外多家药物研发企业建立合作关系。公司始终致力于为各科研院校、企业和机构提供高效、准确、高性价比的蛋白质(组)研究技术包裹,助力客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破,为生命科学的发展做出贡献。
 

百泰派克技术平台

检测分析平台:多台高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱,NMR。
蛋白质组分析平台:Label-free、iTRAQ、SILAC、SWATH、MRM;蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析、发现疾病标记物、发现药物靶标。
代谢组分析平台:靶向代谢组学、非靶向代谢组学、脂质组学分析;通量达1000种代谢分子、代谢通路分析、代谢靶标鉴定。流式细胞多因子检测平台:CBA、FlowCytomix;微量样品需求,分析多种细胞因子。
蛋白质从头测序平台:Obitrap Fusion Lumos质谱仪、PEAKS软件分析;100%序列测定,精准蛋白、抗体测序。
生物制药分析平台:生物药物鉴定、变异性分析、纯度分析。
流式细胞多因子检测平台:CBA、FlowCytomix;微量样品需求,分析多种细胞因子。


 
资料格式:

多肽从头测序.pdf

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