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SILAC定量蛋白组分析

455 人阅读发布时间:2021-04-27 11:24

基于SILAC/Dimethyl标记的定量蛋白组分析

SILAC是细胞培养条件下稳定同位素标记技术(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture, SILAC)的简称。SILAC实验流程是:细胞培养基中加入轻、中或重型稳定同位素标记的必需氨基酸赖氨酸(Lys)和精氨酸(Arg),在细胞生长过程中使新合成的蛋白会带上稳定同位素标签。等量混合各类型蛋白质,酶解后进行质谱分析。通过比较一级质谱图中不带标记/带同位素标记质谱峰型的面积大小进行相对定量,同时二级谱图对肽段进行序列测定从而进行蛋白鉴定。与SILAC类似,二甲基Dimethyl标记也是一种同位素蛋白标记的方法。Dimethyl是一种小分子同位素化学标记物,通过化学标记的方法标记细胞裂解后的蛋白或多肽的N端或者赖氨酸的ε氨基基团,使蛋白/多肽标记上不同的Dimethyl标签。除了标记方法的差别外,SILAC/Dimethyl两种标记的质谱分析方法基本一致,而且具有相近的分析精度和广度,在定量蛋白组学分析研究中受到越来越广泛的运用。

百泰派克公司采用Thermo FisherQ ExactiveHF质谱平台,Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,推出基于SILAC/Dimethyl的定量蛋白组分析服务技术包裹,您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的细胞寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括细胞培养、细胞标记、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

SILAC定量蛋白组学实验流程


SILAC定量蛋白组学实验流程

关于样品

1.您只需使用干冰将冻存细胞寄给我们即可,同时保证细胞具有可以传代培养5次以上的能力;

2.如果您需要自己标记细胞并完成细胞的刺激等处理过程,您只需要将标记完成并且经过处理的细胞样品或者蛋白样品干冰寄给我们即可;对于每个样品,需要保证含有50-100ug蛋白。

SilacDimethyl标记法对比


 

SIALCDimethyl标记法对比

总的来说,SILAC的重复性比Dimethyl稍高一些,因为不同的SILAC样品在蛋白酶切之前就已经混合在一起,而Dimethyl标记的是酶切后的多肽片段,受到体系稳定性影响更多,因此重复性稍逊于SILAC。但是Dimethyl作为一种优质价廉的标记手段也得到越来越广泛的应用。

/英文项目报告

在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:

1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 鉴定的磷酸化位点的详细信息
4. 质谱图片
5. 原始数据

SILAC/Dimethyl定量蛋白组学一站式服务

您只需下单-寄送样品
百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告




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关于百泰派克

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP)成立于2015年,是国家级高新技术企业,业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块,从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关技术服务,为客户提供高性价比、高效率的技术服务。深耕蛋白鉴定、定量蛋白组(iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATCH)、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰(二硫键、糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化等)、靶向和非靶向代谢物检测。

百泰派克生物科技检测平台包括:检测分析平台、蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白质从头测序平台、生物制药分析平台和流式细胞多因子检测平台。公司拥有独立的质谱实验室、色谱实验室、细胞培养室和免疫学实验室,以及高分辨率质谱仪和高效液相色谱。目前已与国内外多家药物研发企业,以及哈佛大学、北京大学在内的国内外高校建立了合作关系,协助客户发表了多篇中英文文章,包括Cell等多家高水平期刊。

公司自主检测平台发展至今,已覆盖蛋白质组学、代谢组学、生物制药、生信分析等多组学检测平台,积累了丰富的实践经验,凭借专业的技术和优质的服务水平,客户覆盖北京大学、清华大学、中科院等多所知名院校,也与国内外多家药物研发企业建立合作关系。公司始终致力于为各科研院校、企业和机构提供高效、准确、高性价比的蛋白质(组)研究技术包裹,助力客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破,为生命科学的发展做出贡献。
 

百泰派克技术平台

检测分析平台:多台高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱,NMR。
蛋白质组分析平台:Label-free、iTRAQ、SILAC、SWATH、MRM;蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析、发现疾病标记物、发现药物靶标。
代谢组分析平台:靶向代谢组学、非靶向代谢组学、脂质组学分析;通量达1000种代谢分子、代谢通路分析、代谢靶标鉴定。流式细胞多因子检测平台:CBA、FlowCytomix;微量样品需求,分析多种细胞因子。
蛋白质从头测序平台:Obitrap Fusion Lumos质谱仪、PEAKS软件分析;100%序列测定,精准蛋白、抗体测序。
生物制药分析平台:生物药物鉴定、变异性分析、纯度分析。
流式细胞多因子检测平台:CBA、FlowCytomix;微量样品需求,分析多种细胞因子。


 
资料格式:

基于SILAC、Dimethyl标记的定量蛋白组分析.pdf

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