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基于质谱的序列分析

162 人阅读发布时间:2021-04-27 10:32

基于质谱的序列分析

基于质谱的蛋白质,抗体,多肽等样品的序列分析,是对样品氨基酸序列的分析。质谱测序即指基于质谱对样品一级结构氨基酸序列的测定。在进入质谱序列分析之前,我们先对几个定义进行简单的介绍。氨基酸是含有胺(-NH2)和羧基(-COOH)官能团以及每个氨基酸特有的侧链(R基团)的有机化合物。肽是由肽键连接的两个至五十个氨基酸组成的短链。多肽是更长,连续,不分支的肽链,最多可包含约五十个氨基酸的较长的肽链。包含五十个以上氨基酸的多肽/肽链被称为蛋白质。蛋白质由一种或多种以生物学功能基团方式排列的多肽组成,通常可结合至配体(例如辅酶和辅因子),另一种蛋白质,其他大分子(例如DNARNA)或更复杂的大分子装配体。抗体(Ab),也称为免疫球蛋白(Ig)则是主要由浆细胞产生的大的Y形蛋白质,被免疫系统用来中和病原体,例如病原细菌和病毒。

相关服务:

基于质谱的蛋白测序
基于质谱的抗体测序
基于质谱的多肽测序
Edman降解法而言,质谱法测序的优点在于,质谱法更敏感,可以更快地裂解肽,可以识别末端封闭或修饰的蛋白样品。百泰派克生物科技利用现有的高分辨率质谱技术平台,提供以质谱为基础的序列分析服务,可实现对所测定靶蛋白序列100%的覆盖。
技术资料图片1 
质谱测序示意图
蛋白样品序列分析过程一般只会使用Trypsin对蛋白进行酶切,鉴定到的肽段覆盖率大概在60%。为了得到靶蛋白的全部序列信息,百泰派克生物科技会选用在蛋白序列分析过程中常用的6种蛋白酶(TrypsinChymotrypsinAsp-NGlu-CLys-CLys-N)分别对靶蛋白进行酶切和质谱测定,在得到碎裂肽段片段的同时,经过肽段之间的拼接完成蛋白序列100%的测定。百泰派克使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪实现对蛋白样品的序列分析,Obitrap Fusion Lumos质谱仪是现在分辨率和灵敏度最高的质谱仪,保证了低丰度肽段碎裂片段鉴定的灵敏度;同时在肽段碎裂过程中采取HCDETD结合的模式,保证肽段碎裂片段的完整性。可以实现蛋白样品的N端,C端序列分析,蛋白全长序列分析。对未知理论序列的样品,可通过从头测序法进行序列分析。

百泰派克提供以下基于质谱的序列分析服务:

蛋白质N/C端测序

蛋白全序列测定

基于Top down自上而下法的蛋白质测序




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关于百泰派克

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP)成立于2015年,是国家级高新技术企业,业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块,从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关技术服务,为客户提供高性价比、高效率的技术服务。深耕蛋白鉴定、定量蛋白组(iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATCH)、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰(二硫键、糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化等)、靶向和非靶向代谢物检测。

百泰派克生物科技检测平台包括:检测分析平台、蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白质从头测序平台、生物制药分析平台和流式细胞多因子检测平台。公司拥有独立的质谱实验室、色谱实验室、细胞培养室和免疫学实验室,以及高分辨率质谱仪和高效液相色谱。目前已与国内外多家药物研发企业,以及哈佛大学、北京大学在内的国内外高校建立了合作关系,协助客户发表了多篇中英文文章,包括Cell等多家高水平期刊。

公司自主检测平台发展至今,已覆盖蛋白质组学、代谢组学、生物制药、生信分析等多组学检测平台,积累了丰富的实践经验,凭借专业的技术和优质的服务水平,客户覆盖北京大学、清华大学、中科院等多所知名院校,也与国内外多家药物研发企业建立合作关系。公司始终致力于为各科研院校、企业和机构提供高效、准确、高性价比的蛋白质(组)研究技术包裹,助力客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破,为生命科学的发展做出贡献。
 

百泰派克技术平台

检测分析平台:多台高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱,NMR。
蛋白质组分析平台:Label-free、iTRAQ、SILAC、SWATH、MRM;蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析、发现疾病标记物、发现药物靶标。
代谢组分析平台:靶向代谢组学、非靶向代谢组学、脂质组学分析;通量达1000种代谢分子、代谢通路分析、代谢靶标鉴定。流式细胞多因子检测平台:CBA、FlowCytomix;微量样品需求,分析多种细胞因子。
蛋白质从头测序平台:Obitrap Fusion Lumos质谱仪、PEAKS软件分析;100%序列测定,精准蛋白、抗体测序。
生物制药分析平台:生物药物鉴定、变异性分析、纯度分析。
流式细胞多因子检测平台:CBA、FlowCytomix;微量样品需求,分析多种细胞因子。


 
资料格式:

基于质谱的序列分析.pdf

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