多组学整合分析常见问题与解答（二）

Q1.转录组测序，液氮速冻后能以-20代替-80存放吗？

A:

液氮速冻后，不能以-20°C代替-80°C长期存放。如果需要暂时使用-20°C进行存放，需要注意以下几点：

• 时间长度：短期存放（如几天到一周）问题一般不大，但不建议长时间存放在-20°C。RNA在-20°C的降解速率比在-80°C更快，尤其是如果样本反复冻融，会导致RNA质量显著下降。

• 储存条件：如果必须在-20°C存放，尽量减少样本的冻融循环。可以将样本分装成小的等份，这样在使用时只需解冻所需的部分。

• 储存介质：样本应存放在RNase-free的管中，并且可以加入RNA保护剂（如RNA later），以进一步保护RNA的完整性。

• 检测RNA质量：从-20°C转回-80°C后，在使用前应检测RNA的完整性和质量（如通过Agilent Bioanalyzer或RNA质检试剂盒），确保RNA没有显著降解。

此外，不同类型的样本在-20°C的储存时间也有所不同。细胞培养物、植物样品一般可在-20°C储存几天，组织样品可达一周，血液样本建议马上置于-80°C储存。

Q2.转录组与全基因组测序有什么区别？

A:

转录组测序与全基因组测序主要有以下区别：

一、研究对象

1.转录组测序：研究RNA，关注基因表达。

2.全基因组测序：研究DNA，关注基因序列。

二、信息类型

1.转录组测序：提供基因表达水平和转录变异信息。

2.全基因组测序：提供完整的基因组序列和变异信息。

三、应用领域

1.转录组测序：用于研究基因表达调控、转录本多样性。

2.全基因组测序：用于研究基因组结构、突变、进化关系。

Q3.尿液标本能检查细菌吗?可以检查18s/16s/rRNA还有宏基因吗?

A:

尿液标本可以被用来检查细菌。通常先通过培养基培养尿液中的细菌，再用显微镜观察就可以检测到。这种方式可以帮助医生确定病人是否有尿道感染，确定感染的细菌种类。

尿液样本可以用于18s/16s/rRNA检测。16S rRNA存在于所有细菌中，可以被用来识别和分类细菌种类。18S rRNA主要存在于真核生物中，可以被用来识别和分类真核生物。通过对尿液样本中的这些RNA进行PCR扩增和测序，可以获得尿液中微生物种群的信息。

尿液宏基因组研究也是可行的。宏基因组学是一种研究环境样本中所有基因组的技术，不需要先将微生物单独分离培养。通过对尿液样本进行宏基因组测序，可以获得尿液中微生物群落的组成信息，包括细菌、病毒、真菌等所有类型的微生物。

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