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技术资料/正文
差异表达蛋白质的聚类分析
575 人阅读发布时间：2021-04-27 16:44
差异表达蛋白质的聚类分析
为检验所选取的差异表达蛋白质或特征差异表达蛋白质的合理性和准确性，可以通过聚类分析将蛋白按照表达量的趋势聚合在一起，可以实现更为直观的蛋白质组学数据分析。1. 层次聚类分析
对筛选出的差异表达蛋白做层次聚类分析，将具有相同或相似表达模式的蛋白进行聚类。差异表达蛋白聚类结果如下图：
图1 差异表达蛋白层次聚类图注：图中不同的列代表不同的样品，不同的行代表不同的蛋白。颜色代表了蛋白在样品中的表达量水平。
2. K-means聚类分析
为研究蛋白在不同实验处理下的表达模式，对样品的表达量进行K-means聚类分析，同一类的蛋白在不同的实验处理下具有相似的变化趋势，具有相似变化趋势的蛋白往往具有相似的功能：
图2 差异表达蛋白聚类折线图注：x轴表示样品分组，y轴表示表达量。黑色线条表示这个cluster中的所有蛋白在不同实验条件下相对表达量的平均值的折线图。
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关于百泰派克
北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）成立于2015年，是国家级高新技术企业，业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块，从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关技术服务，为客户提供高性价比、高效率的技术服务。深耕蛋白鉴定、定量蛋白组（iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATCH）、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰（二硫键、糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化等）、靶向和非靶向代谢物检测。百泰派克生物科技检测平台包括：检测分析平台、蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白质从头测序平台、生物制药分析平台和流式细胞多因子检测平台。公司拥有独立的质谱实验室、色谱实验室、细胞培养室和免疫学实验室，以及高分辨率质谱仪和高效液相色谱。目前已与国内外多家药物研发企业，以及哈佛大学、北京大学在内的国内外高校建立了合作关系，协助客户发表了多篇中英文文章，包括Cell等多家高水平期刊。
公司自主检测平台发展至今，已覆盖蛋白质组学、代谢组学、生物制药、生信分析等多组学检测平台，积累了丰富的实践经验，凭借专业的技术和优质的服务水平，客户覆盖北京大学、清华大学、中科院等多所知名院校，也与国内外多家药物研发企业建立合作关系。公司始终致力于为各科研院校、企业和机构提供高效、准确、高性价比的蛋白质（组）研究技术包裹，助力客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破，为生命科学的发展做出贡献。
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代谢组分析平台：靶向代谢组学、非靶向代谢组学、脂质组学分析；通量达1000种代谢分子、代谢通路分析、代谢靶标鉴定。流式细胞多因子检测平台：CBA、FlowCytomix；微量样品需求，分析多种细胞因子。
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流式细胞多因子检测平台：CBA、FlowCytomix；微量样品需求，分析多种细胞因子。