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技术资料/正文
差异表达蛋白统计分析
488 人阅读发布时间：2021-04-27 16:54
差异表达蛋白质统计分析
蛋白质差异性分析能够极大地推动发现新的生物标志物，提升生物标志物鉴定的精准度，对临床疾病分析具有重要价值。百泰派克能够基于统计学数据提供更精准的蛋白质差异分析，以发现在不同生理状态下和不同组织中的蛋白质水平表现的显著差异。在差异表达蛋白统计过程中，将FC≥1.3(或≤1/1.3)作为差异蛋白的统计标准。FC≥1.3的蛋白认为是上调（up-regulation），FC≤1/1.3的蛋白认为是下调（down-regulation）。差异表达蛋白数目统计如下表：
1. 韦恩图
通过韦恩图可以清晰看出两组差异组合之间的共有和特有差异表达蛋白数量：
图1 差异表达蛋白韦恩图
2. 火山图
通过火山图（Volcano Plot）可以快速地查看蛋白在两个（组）样品中表达水平的差异，以及差异的统计学显著性。
图2 差异表达蛋白火山图
注：差异表达火山图中的每一个点表示一个蛋白，横坐标表示某一个蛋白在两样品中表达量差异倍数的对数值；纵坐标表示t检验p value。横坐标绝对值越大，说明表达量在两样品间的表达量倍数差异越大；纵坐标值越大，表明差异表达越显著，筛选得到的差异表达基因越可靠。图中绿色的点代表差异表达下调蛋白，红色的点代表差异表达上调蛋白，黑色表示非差异表达蛋白。
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关于百泰派克
北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）成立于2015年，是国家级高新技术企业，业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块，从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关技术服务，为客户提供高性价比、高效率的技术服务。深耕蛋白鉴定、定量蛋白组（iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATCH）、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰（二硫键、糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化等）、靶向和非靶向代谢物检测。百泰派克生物科技检测平台包括：检测分析平台、蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白质从头测序平台、生物制药分析平台和流式细胞多因子检测平台。公司拥有独立的质谱实验室、色谱实验室、细胞培养室和免疫学实验室，以及高分辨率质谱仪和高效液相色谱。目前已与国内外多家药物研发企业，以及哈佛大学、北京大学在内的国内外高校建立了合作关系，协助客户发表了多篇中英文文章，包括Cell等多家高水平期刊。
公司自主检测平台发展至今，已覆盖蛋白质组学、代谢组学、生物制药、生信分析等多组学检测平台，积累了丰富的实践经验，凭借专业的技术和优质的服务水平，客户覆盖北京大学、清华大学、中科院等多所知名院校，也与国内外多家药物研发企业建立合作关系。公司始终致力于为各科研院校、企业和机构提供高效、准确、高性价比的蛋白质（组）研究技术包裹，助力客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破，为生命科学的发展做出贡献。
百泰派克技术平台
检测分析平台：多台高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱，NMR。蛋白质组分析平台：Label-free、iTRAQ、SILAC、SWATH、MRM；蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析、发现疾病标记物、发现药物靶标。
代谢组分析平台：靶向代谢组学、非靶向代谢组学、脂质组学分析；通量达1000种代谢分子、代谢通路分析、代谢靶标鉴定。流式细胞多因子检测平台：CBA、FlowCytomix；微量样品需求，分析多种细胞因子。
蛋白质从头测序平台：Obitrap Fusion Lumos质谱仪、PEAKS软件分析；100%序列测定，精准蛋白、抗体测序。
生物制药分析平台：生物药物鉴定、变异性分析、纯度分析。
流式细胞多因子检测平台：CBA、FlowCytomix；微量样品需求，分析多种细胞因子。