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SWATH定量蛋白组学服务

124 人阅读发布时间:2021-04-27 17:32

SWATH定量蛋白组学服务

SWATHSequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)由ETH ZürichDr. Ruedi Aebersold团队与AB SCIEX共同研发的一项全新的质谱采集模式技术。SWATH作为一种DIA (Data Independent Acquisition)技术,将整个质谱扫描质量范围分为若干小窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,使其能够对扫描区间内的所有肽段离子进行高速一级MS扫描再进行二级MS/MS分析。因此,SWATH能够对复杂样品中几乎所有可检测的分子进行定量测定。SWATH综合了shotgun proteomics高通量检测的特点与精准定量分析的优势,是真正意义上的全景质谱检测手段MS/MS ALL 百泰派克公司采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨质谱系统,具有快速扫描速度和串联四极杆质谱系统的定量灵敏度能力,集质谱系统的高分辨、准确质量数稳定性、高灵敏度和高速度扫描特点于一身,推出SWATH定量蛋白组分析服务技术包裹,您只需要将您的样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

SWATH定量蛋白组学服务技术平台

 
SWATH定量蛋白组学服务技术平台

SWATH技术特点

定量鉴定复杂的样品中所有分子,包括低丰度蛋白和肽段
定量准确度高:定量准确度与MRM技术相当
通量大:一次实验可定量检测到2000种以上蛋白
完整全面信息存储,能够存储MSMS/MS每个峰值的数据,同一样本无需进行重复检测
无需像MRM技术需要提前调试样品测定方法

SWATH/DIA的优势介绍

对于复杂样品定量分析主要的问题往往来自于样品本身高丰度蛋白的干扰,从而难以鉴定到低丰度蛋白。许多DDA(Data Dependent Acquisition)质谱鉴定方法,都是在MS级别鉴定肽段,优先筛选MS信号强的肽段进行二级碎裂,因此低丰度的肽段不易被选择进行二级分析。而SWATH/DIA则是对样品中的所有分子无差别地进行分析,并一次性将所有肽段的MSMS/MS数据进行储存,以保证不遗漏任何可能重要的数据。总的来说,SWATH极大地提高了定量分析的可信度,并能够高效测定复杂样品中丰度极低的蛋白分子。
 
DDASWATH/DIA质谱分析的对比


另外,相比MRM需要根据待检测的目标分子进行检测方法优化,SWATH无偏差分析所有分子,不需要提前对检测方法进行优化,只需要在已获得检测数据的基础上对分析方法进行优化即可。因此,SWATH分析能够为您极大得缩短检测分析的周期。

SWATH定量蛋白组学服务样品要求

SWATH定量蛋白组学服务样品要求
SWATH定量蛋白组学服务样品要求

生物信息学分析

• SWATH谱图分析,蛋白质数据质量评估
多组分样本PCA分析
鉴定的蛋白功能注释:GO功能注释、 KEGG功能注释和COG功能注释
差异表达蛋白统计分析:韦恩图、火山图(Volcano Plot
差异表达蛋白聚类分析:层次聚类、K-means聚类
差异蛋白相互作用分析:基于STRING 数据库进行蛋白互作网络分析

/英文项目报告

在最终的技术报告中,百泰会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:

1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 质谱图片
4. 原始数据
5. 蛋白差异水平分析
6. 生物信息学分析

SWATH定量蛋白组学一站式服务

您只需下单-寄送样品
百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告

 


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地址:北京市经济技术开发区科创六街88号院
 

关于百泰派克

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP)成立于2015年,是国家级高新技术企业,业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块,从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关技术服务,为客户提供高性价比、高效率的技术服务。深耕蛋白鉴定、定量蛋白组(iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATCH)、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰(二硫键、糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化等)、靶向和非靶向代谢物检测。

百泰派克生物科技检测平台包括:检测分析平台、蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白质从头测序平台、生物制药分析平台和流式细胞多因子检测平台。公司拥有独立的质谱实验室、色谱实验室、细胞培养室和免疫学实验室,以及高分辨率质谱仪和高效液相色谱。目前已与国内外多家药物研发企业,以及哈佛大学、北京大学在内的国内外高校建立了合作关系,协助客户发表了多篇中英文文章,包括Cell等多家高水平期刊。

公司自主检测平台发展至今,已覆盖蛋白质组学、代谢组学、生物制药、生信分析等多组学检测平台,积累了丰富的实践经验,凭借专业的技术和优质的服务水平,客户覆盖北京大学、清华大学、中科院等多所知名院校,也与国内外多家药物研发企业建立合作关系。公司始终致力于为各科研院校、企业和机构提供高效、准确、高性价比的蛋白质(组)研究技术包裹,助力客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破,为生命科学的发展做出贡献。
 

百泰派克技术平台

检测分析平台:多台高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱,NMR。
蛋白质组分析平台:Label-free、iTRAQ、SILAC、SWATH、MRM;蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析、发现疾病标记物、发现药物靶标。
代谢组分析平台:靶向代谢组学、非靶向代谢组学、脂质组学分析;通量达1000种代谢分子、代谢通路分析、代谢靶标鉴定。流式细胞多因子检测平台:CBA、FlowCytomix;微量样品需求,分析多种细胞因子。
蛋白质从头测序平台:Obitrap Fusion Lumos质谱仪、PEAKS软件分析;100%序列测定,精准蛋白、抗体测序。
生物制药分析平台:生物药物鉴定、变异性分析、纯度分析。
流式细胞多因子检测平台:CBA、FlowCytomix;微量样品需求,分析多种细胞因子。


 
资料格式:

SWATH定量蛋白组学服务.pdf

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